ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕЗУЛЬТАТЫ ПРОГНОЗИРОВАНИЯ НОВЫХ ОБЛАСТЕЙ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ ИЗВЕСТНЫХ ЛЕКАРСТВ
Основой любой научной деятельности является сбор данных, их систематизация и анализ. Одним из лучших средств работы с информацией служат реляционные базы данных (БД) [1].
На данный момент не существует актуальных, легко расширяемых и свободно распространяемых БД биологически активных веществ, позволяющих проводить статистические исследования в целом и поиск взаимосвязей «структура-активность» в частности, а также являющихся удобным инструментом для накопления знаний. Для решения этих задач нами была создана база данных биологически активных веществ (БАВ) - «DRUG».
Текущий этап эволюции разработки программного обеспечения (ПО) характеризуется активным смещением в сторону интернет, поэтому БД «DRUG» изначально разрабатывалась как web-приложение. Такой подход позволил централизованно хранить и обрабатывать большие объемы данных независимо от вычислительных способностей клиента, сделал приложение межплатформенным и не требующим установки дополнительного ПО.
В качестве СУБД (система управления базами данных) была выбрана MySQL. Для создания html-страниц пользовательского интерфейса использован язык «php». Расчет необходимых дескрипторов осуществлялся при помощи открытых библиотек RDKit [2] и checkmol/matchmol [3] или на основе собственных алгоритмов. Конвертирование файлов из различных химических форматов выполняется через библиотеку Open Babel [4].
Химическая структура веществ хранится в виде линейных кодов SMILES и InChI (включая ключ InChIKey). При добавлении нового БАВ в БД можно ввести его химическую структуру через редактор (используется JME Molecular Editor [5]) или загрузить файл в одном из следующих форматов: smi, mol или hin. Для нового вещества рассчитывается молекулярный «отпечаток пальцев»: набор фрагментарных дескрипторов. Это позволяет уменьшить время поиска, удалив из предварительной выборки на основе SQL-запроса не подходящие по параметрам соединения, а затем уже выполнить сравнение «атом-с-атомом». На данный момент БД использует целочисленные, а не бинарные «отпечатки» (их реализация требует достаточных затрат времени, а заметный прирост производительности появляется в базах объемом более 100000 соединений, что не актуально для БАВ). При просмотре вещества БД «DRUG» отображает: название на английском и русском языках, ИЮПАК наименование, брутто формулу и молекулярную массу (вычисляются автоматически), торговые наименования, гиперссылки на другие регистры и базы знаний (CAS, PubChem, DrugBank, PharmGKB и Википедия), ATC-классификацию, описание, показания, механизм действия, применяемые лекарственные формы, виды проявляемой активности, мишени, ссылки на литературу, прикрепленные файлы и дополнительные примечания.
Основным преимуществом баз данных является возможность сложных выборок за очень короткие промежутки времени (несколько минут). В текущей версии БД «DRUG» можно осуществлять несколько видов поиска: по названию (на английском или русском языке, причем запрос на английском языке автоматически транслитерируется, и будут предлагаться варианты на обоих языках), расширенный поиск - представляет собой возможность составления запроса путем комбинирования следующих параметров: функциональной группы, вида активности и произвольно изображенного фрагмента. На рисунке показан снимок экрана результатов поиска по базе веществ соответствующих запросу: «содержат ядро пиримидина и обладают противомалярийной активностью».
Результаты поиска веществ содержащих пиримидин
и обладающие противомалярийной активностью
На данный момент БД «DRUG» содержит информацию о 4609 БАВ (из них 1366 - одобренные к применению лекарственные препараты, 3243 - экспериментальные), 551 вид активностей и 2474 биологические мишени.
Первичное заполнение БД «DRUG» осуществлялось из открытых, преимущественно англоязычных, источников: PubChem, DrugBank и др.
Ингибиторы ангиотензинпревращающего фермента (эналприл, лизиноприл) одни из основных лекарственных средств назначаемых для лечения больных с гипертонической болезнью в развитых странах мира. Известно, что при повышении уровня артериального давления, риск увеличения тромбообразования в сосудистом русле существенно выше, по сравнению с нормальными величинами артериального давления. Гипертоническая болезнь чаще всего развивается в течение длительного времени, и существенное повышение артериальное давление встречается у больных после 50 лет. Свертываемость крови с возрастом, как правило, увеличивается.
Представляло интерес выявить влияние лекарственных средств из группы ингибиторов ангиотензинпревращающего фермента на показатели свертывающей системы крови в экспериментальных условиях.
Экспериментальные исследования проводились на бодрствующих животных (белые крысы) с использованием коагулографа Н-334. Кровь у животных забирали из вен языка (две - три капли). Полученные результаты оценивались относительно контроля и препаратов сравнения с использованием современных методов статистики.
Выявлены достоверные изменения свертываемости крови при назначении белым крысам ингибиторов ангиотензинпревращающего фермента. Показатели свертывающей системы крови понижались на 15-46 % от исходного уровня. Достоверные изменения регистрировали после введения эналаприла и лизиноприла (таблица).
Влияние эналаприла и лизиноприла на показатели свертывающей системы крови у животных (М ± m, секунды)
|
Показатели |
Контрольные опыты |
Эналаприл |
Лизиноприл |
|
Продолжительность свертывания крови |
168 ± 2,4 |
228 ± 7,1* |
193 ± 3,9* |
|
% |
100 % |
136 % |
115 % |
|
Начало свертывания крови |
122 ± 2,3 |
143 ± 2,6* |
142 ± 3,1* |
|
% |
100 % |
117 % |
116 % |
|
Конец свертывания крови |
189 ± 4,5 |
275 ± 6,7* |
270 ± 5,2* |
|
% |
100 % |
146 % |
143 % |
|
Начало ретракции и фибринолиза |
558 ± 7,8 |
768 ± 11,6* |
815 ± 14,2* |
|
% |
100 % |
138 % |
146 % |
Примечание. * - Р < 0,05 по сравнению с контрольными опытами.
Полученные результаты исследования позволяют рекомендовать изученные лекарственные средства для дальнейшего исследования в клинической практике с целью расширения спектра положительных эффектов применяемых препаратов из группы ингибиторов ангиотензинпревращающего фермента.
Список литературы
- Дейт К. Дж. Введение в системы баз данных. - 8-е изд. - М.: Вильямс, 2006. - 1328 с. (дата обращения: 08.02.2011).
- http://rdkit.sourceforge.net/ (дата обращения: 08.02.2011).
- http://merian.pch.univie.ac.at/~nhaider/cheminf/cmmm.html (дата обращения: 08.02.2011).
- http://openbabel.org/ (дата обращения: 08.02.2011).
- http://www.molinspiration.com/jme/ (дата обращения: 08.02.2011).
Отзывы (через Facebook):
Оставить отзыв с помощью аккаунта FaceBook:
Статья в формате PDF 119 KB...
12 11 2019 15:34:54
В результате проведенного исследования установлено, что одними из ведущих патогенетических факторов течения половых инфекций являются нарушения в деятельности иммунной системы. В процессе исследования выявлены изменения в клеточном иммунитете, свидетельствующие о наличии супрессии Т - клеточного звена и наличии диссиммуноглобулинемии. Выявлено, что наиболее выраженные изменения в системе клеточного и гуморального иммунитета обнаружены у больных с хроническим течением инфекционного процесса. ...
09 11 2019 11:52:53
Статья в формате PDF 304 KB...
08 11 2019 6:20:29
Статья в формате PDF 96 KB...
07 11 2019 23:18:26
Статья в формате PDF 127 KB...
06 11 2019 17:53:27
Обсуждается сезонность рождения больных шизофренией. Исследовав 2017 случаев заболевания, авторы отмечают сезонность и гендерные различия в рождении больных шизофренией. Высказывается предположение, что одной из причин сезонных колебаний рождаемости больных, у мужчин, может быть патогенное действие вирусной инфекции на головной мозг плода во втором триместре беременности. ...
05 11 2019 1:27:58
Статья в формате PDF 131 KB...
04 11 2019 22:57:26
Статья в формате PDF 244 KB...
03 11 2019 20:29:26
Статья в формате PDF 113 KB...
02 11 2019 15:44:53
Статья в формате PDF 270 KB...
01 11 2019 23:33:23
Статья в формате PDF 113 KB...
31 10 2019 20:10:59
Статья в формате PDF 121 KB...
30 10 2019 5:34:37
Статья в формате PDF 105 KB...
29 10 2019 16:35:46
Статья в формате PDF 113 KB...
28 10 2019 11:46:46
Статья в формате PDF 128 KB...
27 10 2019 16:54:22
Статья в формате PDF 89 KB...
26 10 2019 8:47:11
1. Второй закон Ньютона в катастрофе это неоспоримый факт. 2. Нужно думать, что после такой катастрофы вся классическая физика полетит к чёрту, вместе с физиками, которые попытаются её защищать. 3. Учёные физики всех стран попали в капкан у них дилемма: или они признают теорию Ростовцева или им грозит скамья подсудимых за ложную науку и обман человечества. ...
25 10 2019 20:31:51
Статья в формате PDF 111 KB...
23 10 2019 8:21:58
В работе впервые приведены сведения об особенностях аудиогенной чувствительности и поведения в «открытом поле» двух групп крыс, гомозиготных по локусу TAG 1A DRD2. ...
22 10 2019 1:44:50
Статья в формате PDF 290 KB...
21 10 2019 2:45:34
Статья в формате PDF 126 KB...
20 10 2019 17:36:22
Статья в формате PDF 134 KB...
19 10 2019 23:18:26
В течение продолжительного времени проводились триботехнические испытания различных термодиффузионных покрытий на изнашивание при трении скольжения. Они позволили сделать ряд принципиальных обобщений по взаимообусловленности структурного состояния покрытий и кинетики процессов износа. В результате моделирования фрикционных процессов широкого класса материалов было получено эмпирическое уравнение для коэффициента трения, отражающее параметрическое влияние свойств материала покрытий, реологию поверхностного трения и свойство смазочного материала. ...
18 10 2019 3:51:51
Статья в формате PDF 127 KB...
17 10 2019 3:37:54
Статья в формате PDF 100 KB...
15 10 2019 17:13:42
Статья в формате PDF 120 KB...
14 10 2019 9:27:32
Статья в формате PDF 111 KB...
13 10 2019 22:50:22
Статья в формате PDF 116 KB...
12 10 2019 18:12:38
Статья в формате PDF 848 KB...
10 10 2019 8:29:52
Статья в формате PDF 105 KB...
09 10 2019 5:42:48
Статья в формате PDF 239 KB...
08 10 2019 19:17:19
Статья в формате PDF 154 KB...
06 10 2019 9:11:26
Статья в формате PDF 90 KB...
05 10 2019 1:40:40
Статья в формате PDF 159 KB...
04 10 2019 9:22:58
Статья в формате PDF 119 KB...
03 10 2019 21:43:17
Статья в формате PDF 126 KB...
01 10 2019 3:14:14
Современный этап развития мирового и отечественного языкознания характеризуется антропоцентрической направленностью лингвистических исследований. Антропоцентризм является одним из фундаментальных свойств человеческого языка, так как взаимосвязь и взаимообусловленность языка и человека очевидна и не может вызывать никаких сомнений. « Идею антропоцентричности языка в настоящее время можно считать общепризнанной: для многих языковых построений представление о человеке выступает в качестве естественной точки отсчета» [1, 5]. Антропоцентрический подход в изучении языка или антропоцентрическая парадигма предполагает анализ человека в языке и языка в человеке. В. А. Маслова пишет, что «…антропоцентрическая парадигма выводит на первое место человека, а язык считается конституирующий характеристикой человека, его важнейшей составляющей. Человеческий интеллект, как и сам человек, немыслим вне языка и языковой способности как способности к порождению и восприятию речи. Если бы язык не вторгался во все мыслительные процессы, если бы он не был способен создавать новые ментальные пространства, то человек не вышел бы за рамки непосредственно наблюдаемого. Текст, создаваемый человеком, отражает движении человеческой мысли, строит возможные миры, запечатлевая в себе динамику мысли и способы ее представления с помощью средств языка» [1, 8]. ...
30 09 2019 12:57:25
Статья в формате PDF 250 KB...
29 09 2019 18:21:42
Статья в формате PDF 220 KB...
28 09 2019 15:40:19
Учебный предмет география состоит из двух блоков. Физическая география изучает элементы природы как единое целое, формирует “образ территории”. Социально-экономическая география рассматривает развитие общества и экономики в тесной взаимосвязи с природными условиями. Для формирования и поддержания интереса к географии в Ф Т Л № 1 широко используются современные информационные технологии. Компьютерное тестирование систематически используется на уроках. Лицеисты успешно участвуют в различных телекоммуникационных олимпиадах - индивидуальных и групповых конкурсах с использованием электронной почты и сети Интернет. Такие проекты развивают умение работать с различными источниками информации, способствуют межпредметной интеграции знаний и формированию целостной картины мира. ...
27 09 2019 6:43:11
Статья в формате PDF 121 KB...
26 09 2019 0:15:38
Статья в формате PDF 124 KB...
23 09 2019 20:54:15
Статья в формате PDF 103 KB...
22 09 2019 14:25:14
Статья в формате PDF 99 KB...
21 09 2019 9:29:42
Статья в формате PDF 292 KB...
20 09 2019 5:25:36
Статья в формате PDF 342 KB...
19 09 2019 21:53:19
Статья в формате PDF 343 KB...
18 09 2019 12:28:57
При хроническом отравлении солями молибдена и хрома определены функциональные нарушения у экспериментальных животных. Изменения в плазме крови выявили нарушения желудочно-кишечного тракта, печени, почек, сердечной мышцы крыс. ...
17 09 2019 12:27:33
Статья в формате PDF 114 KB...
15 09 2019 16:18:33
Статья в формате PDF 97 KB...
14 09 2019 12:37:46
Статья в формате PDF 143 KB...
13 09 2019 14:20:44
Статья в формате PDF 507 KB...
12 09 2019 21:13:57
Установлен факт защитного влияния нового бионического режима импульсно-гипоксических адаптаций на восстановительные процессы коры мозга после удаления внутричерепных опухолей у нейрохирургических больных. Механизмом протекции мозга от рецидива злокачественных опухолей может быть согласование ритмов энергопродукции и энергопотребления в процессе формирования адаптации. ...
11 09 2019 17:32:39
Статья в формате PDF 311 KB...
09 09 2019 13:18:43
Статья в формате PDF 99 KB...
08 09 2019 22:21:11
Статья в формате PDF 98 KB...
07 09 2019 1:10:10
Статья в формате PDF 1463 KB...
06 09 2019 22:20:27
Статья в формате PDF 90 KB...
05 09 2019 17:19:55
Статья в формате PDF 102 KB...
04 09 2019 11:48:21
Статья в формате PDF 307 KB...
03 09 2019 14:44:34
Статья в формате PDF 118 KB...
02 09 2019 14:43:48
Статья в формате PDF 276 KB...
01 09 2019 13:43:16
В последние годы для сжигания как традиционных топлив, так и биомасс различного происхождения широко применяются газификационные технологии. Газификация чаще всего производится в кипящем слое при недостатке окислителя. Конструкции установок по газификации различных топлив отличаются, но не принципиально. Также близкими оказываются и параметры генераторного газа. Необходимо развитие установок и технологий по совместной переработке различных топлив. ...
31 08 2019 23:24:21
Статья в формате PDF 129 KB...
30 08 2019 3:30:29
Статья в формате PDF 161 KB...
28 08 2019 11:14:50
В работе изучено состояние клинико-иммунологического статуса при хронических и инфекционно-аллергических отитах у собак. Дана сравнительная оценка сочетанного применения меатотимпанальной новокаиновой блокады с лекарственными препаратами при лечении отитов у собак с другими известными методами и изучено их влияние на клеточные и гуморальные звенья иммунной системы. ...
27 08 2019 13:52:35
Статья в формате PDF 160 KB...
26 08 2019 19:29:44
Статья в формате PDF 108 KB...
24 08 2019 18:40:55
Статья в формате PDF 121 KB...
22 08 2019 8:36:35
Статья в формате PDF 90 KB...
21 08 2019 10:30:43
Статья в формате PDF 105 KB...
20 08 2019 21:11:52
Статья в формате PDF 120 KB...
19 08 2019 13:35:29
Статья в формате PDF 174 KB...
18 08 2019 11:12:33
Статья в формате PDF 116 KB...
17 08 2019 8:51:44
Статья в формате PDF 218 KB...
16 08 2019 4:10:38
Статья в формате PDF 103 KB...
15 08 2019 12:41:28
Статья в формате PDF 256 KB...
14 08 2019 23:46:59
Статья в формате PDF 168 KB...
13 08 2019 8:50:28
Статья в формате PDF 590 KB...
12 08 2019 21:33:57
Статья в формате PDF 103 KB...
11 08 2019 2:47:23
Статья в формате PDF 463 KB...
10 08 2019 4:59:38
Построена математическая модель системы управления качеством образования филиала В У За с учетом влияния внешних информационных связей, проведена оценка критерия качества и улучшения внешних связей вследствие внедрения информационной системы. ...
09 08 2019 15:16:33
Статья в формате PDF 104 KB...
08 08 2019 16:39:36
Обзор состояния кормления и причин падежа молодняка лисиц в О О О « Покровское зверохозяйство» Республики Саха ( Якутия) в 2010 г. ...
07 08 2019 7:49:19
Статья в формате PDF 253 KB...
06 08 2019 7:58:50
Статья в формате PDF 94 KB...
02 08 2019 21:43:17
Статья в формате PDF 163 KB...
01 08 2019 10:38:55
Статья в формате PDF 253 KB...
31 07 2019 23:22:23
Статья в формате PDF 119 KB...
30 07 2019 11:11:22
Статья в формате PDF 112 KB...
29 07 2019 14:32:27
Статья в формате PDF 270 KB...
28 07 2019 1:45:56
Статья в формате PDF 365 KB...
26 07 2019 15:46:35
Статья посвящена вопросам изучения антимикробных свойств природных биологически активных соединений – флавоноидов и фенолкарбоновых кислот, извлекаемых методом вихревой турбоэкстракции из сырья растений рода Veronica L. (сем. Scrophulariaceae Juss.) Предуралья. На основании проведенного исследования авторы делают вывод о возможности применения растительного сырья Veronica L. в медицинской практике. ...
25 07 2019 10:18:15
Статья в формате PDF 113 KB...
24 07 2019 13:49:11
Статья в формате PDF 240 KB...
23 07 2019 10:39:59
Статья в формате PDF 199 KB...
22 07 2019 22:59:48
Выбрать оптимальный метод введения больных в период реабилитации после черепно-мозговой травмы. Материалы и методы: За 2011 год в Новокуйбышевской центральной городской больницы пролечено 960 пострадавших с черепно-мозговой травмой, из них 780 пострадавших с сотрясением головного мозга. Все пациенты с сотрясением головного мозга, первых семь дней находились на стационарном лечении в условиях травматологического отделения. Под наблюдением врачей нейрохирурга, травматолога, невролога и окулиста, проводилась дегидратационная и симптоматическая терапия. После первой недели стационарного лечения данных пациентов разделили на три равных группы по 260 человек и в дальнейшем их вели по- разному. Результаты: Удовлетворительные результаты лечения получены в первой группе у 252 пациентов (97%), у второй группы 243 пациентов(93%), а в третьей 156 пациентов (60%). Один день дневного стационара в травматологическом отделение в Новокуйбышевской центральной городской больницы Н Ц Г Б стоит 360 рублей, а один день дневного стационара, стоит 190 рублей. Таким образом стоимость лечения пациентов первой группы = (7 + 7)·360 = 5040 рублей, стоимость лечения пациентов второй группы = 7·360 + 7·190 = 2520 + 1330 = 3850 рублей, стоимость лечения пациентов третьей группы = 7·360 = 2520 рублей. Из данных расчетов видно, что пациенты третьей группы, требует меньше расходов, но к сожалению, у них намного хуже результаты лечения. Результаты лечения пациентов первой и второй группы практически одинаковы, а стоимость пациентов второй группы намного меньше. ...
21 07 2019 16:29:39
Статья в формате PDF 100 KB...
20 07 2019 21:10:12
Статья в формате PDF 258 KB...
19 07 2019 9:57:33
Статья в формате PDF 257 KB...
18 07 2019 11:54:18
Статья в формате PDF 129 KB...
15 07 2019 11:13:27
Статья в формате PDF 135 KB...
13 07 2019 11:37:21
Статья в формате PDF 157 KB...
12 07 2019 4:25:27
Статья в формате PDF 110 KB...
10 07 2019 18:28:12
Статья в формате PDF 119 KB...
09 07 2019 10:16:46
Статья в формате PDF 126 KB...
08 07 2019 19:46:10
Статья в формате PDF 100 KB...
07 07 2019 3:17:20
Статья в формате PDF 106 KB...
06 07 2019 6:18:15
Статья в формате PDF 203 KB...
05 07 2019 10:24:58
В статье показано, что ремонт бытовой техники в зависимости от сложности и условий эксплуатации подразделяется на ремонт непосредственно на дому у заказчика, ремонт в мастерской. Ремонт на дому у заказчика связан с выполнением мелкого и среднего ремонта, т.е. когда ремонт технически возможен и экономически целесообразен. Ремонт в мастерской выполняется тогда, когда невозможно его выполнить в домашних условиях. Кроме того , ремонт бывает в гарантийный период и в послегарантийный периоды эксплуатации. Во всех случаях оплата за ремонт осуществляется по своим правилам, ...
03 07 2019 22:50:26
Статья в формате PDF 112 KB...
01 07 2019 19:41:22
Статья в формате PDF 108 KB...
29 06 2019 1:59:25
Статья в формате PDF 263 KB...
28 06 2019 13:18:41
Статья в формате PDF 167 KB...
27 06 2019 13:23:21
Статья в формате PDF 127 KB...
26 06 2019 17:16:19
Статья в формате PDF 84 KB...
25 06 2019 1:28:22
Статья в формате PDF 114 KB...
24 06 2019 2:49:40
Статья в формате PDF 103 KB...
23 06 2019 12:51:32
Статья в формате PDF 189 KB...
22 06 2019 3:43:36
Статья в формате PDF 114 KB...
21 06 2019 0:28:41
Исследованы изменения физиологических показателей школьников в условиях их работы за компьютером в течение учебного года. Дан сравнительный анализ изменений физиологических показателей школьников, отличающихся эмоциональной устойчивостью. Получены результаты, свидетельствующие о неблагоприятном влиянии условий работы за компьютером на школьников младших классов осенью и весной. ...
20 06 2019 22:18:29
Статья в формате PDF 133 KB...
19 06 2019 14:36:25
Статья в формате PDF 128 KB...
18 06 2019 13:22:10
Статья в формате PDF 109 KB...
17 06 2019 15:13:24
Статья в формате PDF 112 KB...
16 06 2019 17:50:13
Еще:
Обзоры -1 :: Обзоры -2 :: Обзоры -3 :: Обзоры -4 :: Обзоры -5 :: Обзоры -6 :: Обзоры -7 :: Обзоры -8 :: Обзоры -9 :: Обзоры -10 :: Обзоры -11 ::
Последовательность подготовки научной работы может быть такой: